条带热图由共享X轴的多条渐变条带组成,其颜色表示某一特征值。
与之前分享的线型热图相比,条带热图的优势在于,其能够更好地刻画细节变化,也因此可以在一些顶级期刊中看到它的身影,比如《Science》:
由于Matlab中未收录条带热图的绘制函数,因此需要大家自行设法解决。
本文使用自己制作的stripheatmap小工具进行条带热图的绘制,先来看一下成品效果:
特别提示:本期内容『数据+代码』已上传资源群中,加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以关注同名公号【阿昆的科研日常】,后台回复关键词【绘图桶】查看加入方式。
1. 数据准备
此部分主要是读取原始数据,并初始化绘图参数。
% 读取数据
load data.mat
% 初始化参数
x = X;
y = Y;
z = Z;
sw = 15; % 条带宽度
2. 颜色定义
作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。
这里直接使用TheColor配色工具中的SCI权威配色库:
%% 颜色定义
map = TheColor('sci',496,'map',256);
% map = flipud(map);
获取方式:公众号(阿昆的科研日常)后台回复 TC
3. 条带热图绘制
调用‘stripheatmap’命令,绘制初始条带热图。
stripheatmap(x,y,z,sw)
hTitle = title('Strip Heatmap Plot');
hXLabel = xlabel('K (w)');
hYLabel = ylabel('Samples');
view(0,90)
4. 细节优化
为了插图的美观,将初始条带热图赋上之前选择的颜色:
% 赋色
colormap(map)
colorbar
然后,对坐标轴细节等进行美化,设置完毕后,以期刊所需分辨率、格式输出图片。
%% 图片输出
figW = figureWidth;
figH = figureHeight;
set(figureHandle,'PaperUnits',figureUnits);
set(figureHandle,'PaperPosition',[0 0 figW figH]);
fileout = 'test';
print(figureHandle,[fileout,'.png'],'-r300','-dpng');
也可以尝试其它配色:
以上。